Sobre o Projeto

Ester Sabino, MD PhD, Investigadora Principal

Diagnóstico Clínico

Diretora do Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Ela coordena todas as atividades no Brasil. Seu laboratório é responsável pelo sequenciamento e descoberta de vírus. Juntamente com Dr. Faria, ela supervisiona todas as atividades do programa.

Nuno Faria, MSc PhD, Investigador Principal

Genômica, Epidemiologia e Cartografia

Professor Associado, Wellcome Trust e Royal Society Sir Henry Dale Fellow no Departamento de Zoologia da Universidade de Oxford e Professor Visitante no Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Nuno coordena as equipes do Reino Unido e lidera a integração de dados genômicos, geográficos e epidemiológicos. Juntamente com o Dr. Sabino, ele supervisiona todas as atividades do programa.

Nicholas Loman, MB PhD Co-Investigador Principal

Genômica e metagenômica

Professor de Genômica Microbiana e Bioinformática da Universidade de Birmingham e pesquisador principal do projeto ZiBRA entre 2016-2017. Ele tem um histórico de alto nível em sequenciamento de patógenos e desenvolvimento de métodos em bioinformática. O Prof. Loman é responsável pelos componentes de desenvolvimento de métodos de biologia molecular, sequenciamento e bioinformática do CADDE.

Oliver Pybus, DPhil Co-Investigador Principal

Genômica, Epidemiologia e Evolução

Professor de Evolução e Doenças Infecciosas no Departamento de Zoologia da Universidade de Oxford. Ele é co-diretor do Oxford Martin School Programme on Pandemic Genomics e editor-chefe da revista Virus Evolution. Ele lidera a análise genômica de vírus e a integração de fluxos de dados genômicos, geográficos e epidemiológicos.

Mauricio L. Nogueira, MD PhD Co-Investigador Principal

Arbovirologia e Genômica

Professor da Faculdade de Medicina da Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto . Ele estabeleceu uma coorte populacional para entender a infecção por arbovírus apoiada pela FAPESP e pelo Instituto Nacional de Saúde. Sua equipe coordena o sequenciamento genômico dos arbovírus e valida as abordagens (meta) genômicas em São José do Rio Preto.

Maria Anice Sallum, MD PhD Co-Investigador Principal

Taxonomia e Ecologia de Vetores

Professora da Escola de Saúde Pública da Universidade de São Paulo com longa experiência na área de entomologia. Ela supervisiona o trabalho de detecção de mosquitos conjuntamente com Dr. Adriano Pinter e o Dr. Renato de Souza. Sua equipe coleta e analisa vetores nas principais regiões do Estado de São Paulo.

Anna Sara Levin, MD PhD Co-Investigador Principal

Epidemiologia Clínica

Professora do Departamento de Doenças Infecciosas e Parasitárias da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo , e coordenadora do grupo de controle de infecção hospitalar do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo . A professora Levin foi coordenadora do ensaio clínico Febre Amarela (SOFFA) e supervisiona os estudos epidemiológicos clínicos relacionados à infecção pelo vírus da febre amarela no Estado de São Paulo.

Renato Aguiar, PhD Co-Investigador Principal

Genômica Viral e Virologia Clínica

Aguiar é professor do Departamento de Genética, Ecologia e Evolução da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), e também é Professor Associado do Departamento de Genética da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Ele tem experiência na área de Genética, Biologia Celular e Microbiologia em conexão com Virologia Molecular, com foco em projetos que garantem interações moleculares entre fatores virais e celulares e seu papel na patogênese viral. Aguiar possui experiência em epigenética, regulação genética e genética em modelos virais e desenvolvimento de novos agentes antivirais. Ele trabalha com HIV, HCV, SIV, Dengue, Chikungunya, Oropouche, Zika, Febre Amarela e, mais recentemente, Mayaro, e foi consultor científico em projetos de pesquisa aplicados ao HIV / AIDS em parceria com o Center of Disease Control (CDC, EUA). ) e UFRJ em Moçambique e Angola.

Philippe Mayaud, MD PhD, Co-Investigador Principal

Epidemiologia

Professor de doenças infecciosas e saúde reprodutiva da Escola de Higiene e Medicina Tropical de Londres, Faculdade de Doenças Infecciosas e Tropicais; e o chefe do programa de pesquisa em HIV da unidade de pesquisa MCR / UVRI & LSHTM em Uganda, à qual ingressou em 2019. Ele trabalha na Guiana Francesa e na Dominica há quatro anos. Clínico que se tornou epidemiologista, Philippe tem um interesse particular em HIV / AIDS e infecções sexualmente transmissíveis (DST) e conduz vários projetos de pesquisa em epidemiologia de arbovírus no Brasil e na China. Philippe ocupa cargos honorários como professor visitante no Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo e na Universidade de Witwatersrand, na África do Sul.

Vivian Silva, MD PhD, Co-Investigador Principal

Epidemiologia Clínica

Supervisor de Pesquisa Médica do Departamento de Doenças Infecciosas e Parasitárias da Faculdade de Medicina da USP e coordenador dos projetos ZIKAlliance da Universidade de São Paulo. Ela supervisiona os estudos de epidemiologia clínica relacionados ao zika, febre amarela e infecção pelo vírus chikungunya.

Renato Souza, PhD Co-Investigador Principal

Virologia e Entomologia

Pesquisador do Instituto Adolfo Lutz , Laboratório de Saúde Pública do Estado de São Paulo. O Dr. Renato é responsável por coordenar os metadados e os dados de ocorrência das epidemias em curso de febre amarela, Chikungunya, Zika e dengue. Ele analisa os dados em colaboração com as equipes LSHTM e Oxford.

Neal Alexander, PhD Co-Investigador Principal

Epidemiologia

Professor de estatística médica e epidemiologia na Escola de Higiene e Medicina Tropical de Londres . Ele reside em Cali, Colômbia, onde lidera a Unidade de Epidemiologia e Bioestatística do Centro Internacional de Entrevista e Investigação Médica (CIDEIM ). Ele teve um papel de liderança no desenho e análise de vários ensaios randomizados por cluster de intervenções contra os vetores mosquitos da dengue. Ele é o líder temático da metodologia no Grupo de Epidemiologia Tropical do Conselho de Pesquisa Médica do Reino Unido na LSHTM e membro do World Grupo Consultivo para Controle de Vetores de Organizações de Saúde (VCAG).

Adriano Pinter, PhD Co-Investigador Principal

Vigilância em saúde pública

Diretor Científico da Superentendência de Controle de Endemias (SUCEN), Instituição de Saúde Pública responsável pelo controle de doenças infecciosas endêmicas no Estado de São Paulo. Durante a epidemia de febre amarela, ele desenvolveu um modelo geográfico para definir e orientar prioridades em vacinação no Estado de São Paulo.

Marcelo Urbano Ferreira, MD PhD Co-Investigador Principal

Epidemiologia Espacial e Digital, Saúde Pública de Precisão

Josh Quick, PhD

Genômica e Metagenômica

Bolsista UKRI Future Leaders desenvolvendo métodos para previsão rápida de AMR no Instituto de Microbiologia e Infecção, Universidade de Birmingham, Reino Unido. Josh desenvolveu vários protocolos genômicos para o projeto ZiBRA , e vem trabalhando em estreita colaboração com o Loman Labs , o projeto CADDE e a rede ARTIC para desenvolver abordagens metagenômicas rápidas para a descoberta de patógenos.

Charlys da Costa, Pharm. D, PhD

Metagenômica viral e descoberta de vírus

Pesquisador de pós-doutorado no Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, apoiado pela FAPESP . Charlys está interessado em metagenômica viral e descoberta de vírus . Charlys realiza todo o seqüenciamento genômico de amostras coletadas em várias coortes, e ele realiza o seqüenciamento metagenômico viral para casos com etiologia desconhecida.

Oliver Brady, DPhil

Epidemiologia

Professor assistente e Sir Henry Wellcome Fellow na Escola de Higiene e Medicina Tropical de Londres . A pesquisa do Dr. Brady se concentra na distribuição espacial global, disseminação e carga de doenças transmitidas por mosquitos, usando modernas abordagens de modelagem e mapeamento epidemiológico. Ele foi um membro importante da dengue grande ( Consórcio Internacional de Pesquisa em Avaliação, Gerenciamento e Vigilância de Riscos da Dengue ) e Zika (ZIKAlliance ) financiados pela UE e trabalha em estreita colaboração com os Ministérios da Saúde da América do Sul e da Ásia. Seu envolvimento no CADDE permitirá o desenvolvimento de modelos adequados aos dados de vigilância em tempo real para prever a disseminação espacial de novas epidemias.

Kath O’Reilly, PhD

Epidemiologia

A Dra. Kath O’Reilly é professora assistente na Escola de Higiene e Medicina Tropical de Londres . O Dr. O’Reilly é um epidemiologista especializado no uso de modelos estatísticos e matemáticos para auxiliar no desenvolvimento de estratégias de controle para doenças infecciosas. Ela está particularmente interessada em doenças virais que estão sendo direcionadas para eliminação e erradicação. A pesquisa em andamento inclui a aplicação de modelos para erradicação da poliomielite e doenças transmitidas por vetores, como o zika e o vírus da dengue. Kath analisará os dados de vigilância epidemiológica do CADDE e trabalhará com colegas para entender e antecipar a transmissão de arbovírus.

Janey Messina, PhD Co-Principal Investigator

Epidemiologia e Cartografia Genômica

Dr. Messina é atualmente professor associado da Escola de Geografia e Meio Ambiente. Ela possui um bacharelado pela Universidade da Califórnia, Los Angeles, um mestrado pela Universidade de Illinois em Urbana-Champaign e um doutorado pela Universidade da Carolina do Norte – Chapel Hill. Sua pesquisa de doutorado se concentrou na geografia e epidemiologia do HIV, malária e anemia na República Democrática do Congo. Janey foi pesquisadora sênior de pós-doutorado no Grupo de Epidemiologia e Ecologia Espacial no Departamento de Zoologia, Universidade de Oxford . Ela coordenou a contribuição do grupo ao Consórcio Internacional de Pesquisa em Avaliação, Gerenciamento e Vigilância de Riscos da Dengue , concentrando sua pesquisa em padrões globais e fatores determinantes da dengue transmissão de vírus, bem como possíveis mudanças na paisagem e epidemiologia da doença resultantes de fatores como urbanização, mudanças climáticas e mudanças econômicas.

Moritz Kraemer, PhD

Dinâmica espacial e epidemiologia

O Dr. Moritz Kraemer investiga a dinâmica espacial das doenças infecciosas e seus vetores. Ele aplica e desenvolve principalmente estruturas de modelagem estocástica mecanicista, a fim de entender seu processo de invasão. Seu objetivo é integrar dados genéticos em tais análises.

Nelson da Cruz Gouveia MD, PhD, MSc

Saúde Pública e Medicina Preventiva

Nelson Gouveia é formado em Medicina (1986) pela Universidade Federal de São Paulo, Brasil, e mestre em Epidemiologia (1993) e doutor em Saúde Pública (1998) pela London School of Hygiene and Tropical Medicine da University of London , UK. Atualmente, é professor do Departamento de Medicina Preventiva da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, onde ensina métodos epidemiológicos básicos para estudantes de medicina e epidemiologia ambiental para estudantes de pós-graduação. Seus interesses de pesquisa incluem uma ampla variedade de exposições ambientais e seus efeitos na saúde, como poluição do ar ambiente e mudanças climáticas, e a utilização de sistemas de informação geográfica (SIG) para modelagem de exposição em epidemiologia ambiental. Ele também está interessado na aplicação de resultados de estudos epidemiológicos na área de políticas públicas de saúde. (Fonte: Currículo Lattes)

Izabel Oliva Marcilio de Souza, PhD

Vigilância Epidemiológica

Médica sanitário, doutora em ciências pelo Departamento de Medicina Preventiva da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP). Coordenador do Centro de Vigilância Epidemiológica do Hospital das Clínicas, Faculdade de Medicina da USP. Professora colaboradora na disciplina de Epidemiologia no curso de graduação em Medicina e na residência multidisciplinar em Saúde Pública do mesmo Departamento.

Julien Thézé, PhD

Virologia Computacional

Leonardo Bastos, PhD

Epidemiologia e Estatística

Dr. Bastos é Ph.D. em Estatística do FioCRUZ Rio de Janeiro e atualmente é pesquisador do Departamento de Epidemiologia de Doenças Infecciosas e da Faculdade de Epidemiologia e Saúde da População da London School of Hygiene and Tropical Medicine.

Andreza De Souza Santos, MA, PhD

Política Participativa, Desigualdade e Governos Locais

Dr Andreza de Souza Santos tem Doutorado antropologia pela University of St Andrews, e é atualmente Diretora do Brazilian Studies Programme da Oxford University; que é parte do Latin American Centre.  Os interesses de pesquisa da Andreza incluem política participativa, desigualdades e governos locais. Dr De Souza Santos está colaborando com o CADDE observando a resposta dos governos locais a COVID-19 Pandemia no Brasil.

Lewis Buss, MB

Epidemiologia clínica, Bioestatística, e Atenção Primária.

Dr. Lewis Buss formou-se com distinção em medicina em 2016 pela University of Cambridge e University College London (UCL), Inglaterra. Concluiu residência (Academic Foundation Program) em Nottingham, Reino Unido em 2018. Atualmente mestrando no Departamento de Medicina Preventiva na Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Seus principais interesses são epidemiologia clínica, bioestatística e atenção primária.

Sarah Hill, DPhil

Epidemiologia Genômica e Metagenômica

Pesquisadora de pós-doutorado no Faria lab , no Departamento de Zoologia, Universidade de Oxford . A Dra. Hill estuda uma variedade de sistemas, incluindo a evolução e dinâmica de vírus em populações de animais selvagens e a transmissão de vírus nas redes sociais. A Dra. Hill contribuirá para o desenvolvimento e aplicação de novas técnicas para integrar dados genéticos de vírus com dados clínicos e demográficos tradicionais. Sarah está coordenando as atividades relacionadas ao seqüenciamento de todo o genoma do vírus da febre amarela de humanos, primatas não humanos e diferentes espécies de vetores no Brasil.

Mariana Cunha, PhD

Biologia Molecular e Vigilância Molecular

Pesquisadora Científica do Centro de Virologia, Instituto Adolfo Lutz . A Dra. Cunha é formado em Medicina Veterinária e Zootecnologia pela Universidade de São Paulo (USP). Especializou-se em Saúde Animal, Alimentação e Segurança Ambiental no Instituto de Biociencias-USP e concluiu seu doutorado em Patologia Experimental na FMVZ-UPS. Atualmente, ela é pesquisadora científica III no Centro de Doenças Transmitidas por Vetor no Centro de Virologia, Instituto Adolfo Lutz .

Jaqueline Goes de Jesus, PhD

Epidemiologia Genômica usando ONT

Pesquisadora de pós-doutorado com o Prof. Sabino, no Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo . O Dr. Goes de Jesus é bacharel em Biomedicina pela Faculdade de Medicina e Saúde Pública da Bahia, mestre em biotecnologia em saúde e medicina pela Fundação Oswaldo Cruz e doutor em patologia experimental humana na Universidade Federal da Bahia. O Dr. Goes de Jesus desenvolve pesquisas no campo de arbovírus emergentes, como zika, dengue e febre amarela, e conduziu um estágio no Loman Lab, Universidade de Birmingham , Reino Unido. Ela supervisionará as atividades de sequenciamento CADDE em São Paulo.

William Marciel de Souza, PhD

Epidemiologia genômica e metagenômica

Pesquisador de pós-doutorado com o Prof. Figueiredo, do Centro de Virologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. O Dr. de Souza é bacharel em Biomedicina pela Universidade do Oeste de Santa Catarina e possui mestrado e doutorado pela Universidade de São Paulo. Ele fez um estágio de doutorado no Centro de Pesquisa de Vírus MRC-University of Glasgow, Reino Unido. Ele é membro do Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus, Grupo de Estudo Peribunyaviridae, com vasta experiência em virologia. Atualmente, o Dr. de Souza está trabalhando em estudos prospectivos, genômicos e evolutivos de vírus zoonóticos emergentes e reemergentes no Laboratório Faria .

Andre Luis Acosta, PhD

Análise espacial e ecológica

Pesquisador de pós-doutorado na equipe da Prof. Maria Anice Sallum na Escola de Saúde Pública da Universidade de São Paulo com especial interesse em ecologia de mosquitos vetores e mudanças climáticas. O Dr. Acosta também participa do Centro de Pesquisa em Biodiversidade e Computação da Universidade de São Paulo e no Grupo de Pesquisa em Saúde Planetária da Universidade de São Paulo. O Dr. Acosta concluiu seu bacharelado em biologia pela Universidade Estadual Paulista, um mestrado em biodiversidade pela Universidade do Porto e um doutorado em ecologia na Universidade de São Paulo.

Poliana Lemos, PhD

Entomologia

Pesquisadora de pós-doutorado na equipe da Prof. Maria Anice Sallum, Escola de Saúde Pública da Universidade de São Paulo O Dr. Lemos esteve anteriormente no Centro de Inovações Tecnológicas do Instituto Evandro Chagas , Pará, Brasil. Os interesses de pesquisa do Dr. Lemos incluem virologia, genética, entomologia médica, entomologia molecular, NGS, citogenética de mosquitos, ecologia de insetos aquáticos e vetores de doenças. Dr. Lemos é co-supervisionado pela Prof. Maria Anice Sallum.

Ingra Morales, MSc PhD Candidate

Nanopore Metagenomics

Ingra está fazendo doutorado no Instituto de Medicina Tropical da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo . Ela se formou em Biomedicina na Universidade Federal de Alfenas, Minas Gerais, e possui uma vasta experiência em tempo real, detecção rápida e seqüenciamento NGS de arbovírus no Brasil. Juntamente com o Loman Lab, Universidade de Birmingham , Reino Unido, ela está trabalhando no desenvolvimento de um novo protocolo para detecção rápida arboviral usando seqüenciamento de nanoporos.

Darlan da Silva Candido, MSc DPhil Candidate

Epidemiologia Genômica e Metagenômica

Darlan está interessado em ferramentas filogenéticas e filogeográficas para recriar e entender os determinantes dos surtos virais e como essas informações podem ser traduzidas em recomendações de políticas públicas. Mais especificamente, sua pesquisa se concentra em recentes surtos de arbovírus na América Latina (vírus do zika, chikungunya, dengue e febre amarela), combinando informações genéticas, espaciais e ecológicas. A pesquisa de Darlan é apoiada pelo Fundo Clarendon da Universidade de Oxford e pelo Departamento de Zoologia. Atualmente, ele doutorando no laboratório da Faria.

Sabrina Li, MSc DPhil candidate

Cartografia e Geografia

Sabrina é uma aluna de doutoramento, sediada na Escola de Geografia e Meio Ambiente. Ela está interessada em investigar as interações entre mosquitos, humanos, primatas não humanos e o meio ambiente na febre amarela disseminada no Brasil usando mapeamento e modelagem espacial. Atualmente é candidata do DPhil com o Prof. Pybus e o Prof. Messina.

Carlos Prete

Ciência da Computação

Carlos é um estudante de doutorado focado no desenvolvimento de técnicas para processamento de sinais de emissão acústica para monitoramento estrutural de aeronaves. Este trabalho é realizado em conjunto com a Embraer.

Flávia Sales

Doenças Infecciosas e Saúde Pública

Flavia Sales é formada em Biomédica e atualmente é doutoranda no laboratório da Professora Ester Sabino, no Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo. Ela se interessa por doenças infecciosas de importância para a saúde pública, como arbovírus emergentes (DENV, ZIKV, YFV) e atualmente contribui para a geração de sequências genômicas de SarsCoV-2, utilizando técnicas de sequenciamento de última geração.