Workshop CADDE sobre Metagenômica Portátil para Vigilância de Patógenos – Inscreva-se aqui
Novas abordagens metagenômicas não direcionadas, que detectam a diversidade total de vírus sem conhecimento a priori de quais vírus estão presentes em uma amostra, estão abrindo uma nova era na prevenção e preparação para pandemias.
Nosso workshop fornecerá treinamento prático sobre a geração e interpretação de metagenômica não direcionada portátil para detecção e monitoramento de vírus em tempo real. Pesquisadores que desejam treinamento em preparação de bibliotecas, sequenciamento de genoma portátil, análise e contextualização de dados de sequenciamento usando ferramentas bioinformáticas, filogenéticas e epidemiológicas são bem-vindos.
Nosso workshop será realizado no Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brasil, de 13 a 17 de março de 2023. É organizado em conjunto pela Equipe CADDE e pelo MRC Center for Global Análise de Doenças Infecciosas e reunirá os principais especialistas envolvidos em programas de sequenciamento, vigilância em saúde pública e epidemiologia. Uma versão preliminar do programa do workshop pode ser encontrada aqui: Agenda Preliminar.
Forneceremos treinamento de sequenciamento usando o Oxford Nanopore MinION, um sequenciador de DNA portátil que pode produzir > 20 Gbases de dados de sequência quase em tempo real. Nossa equipe de manifestantes e palestrantes usou esse sistema para rastrear a propagação do Ebola na África Ocidental, monitorar o surto de Zika nas Américas, investigar o maior surto de febre amarela dos últimos 70 anos no Brasil, gerar milhares de genomas de SARS-CoV-2 – incluindo genomas dos primeiros casos de SARS-CoV-2 na América Latina em menos de 48h e os primeiros relatos da Variante Gama de Preocupação em Manaus. Nossos protocolos também foram usados para gerar os primeiros genomas de mpox no Brasil dentro de 16 horas a partir da coleta de amostras.
Como aplicar
As vagas são limitadas e serão alocadas de acordo com os seguintes critérios: os candidatos devem ter formação em biologia, saúde pública, bioinformática e/ou laboratório úmido e estar aptos a participar dos cinco dias do curso. As inscrições serão encerradas no dia 27 de janeiro de 2023, às 17h BRT.
Os candidatos deverão enviar uma declaração escrita de 200 palavras, um currículo e um resumo. Temos 40 vagas para candidatos de todo o mundo. A inscrição é gratuita e a acomodação pode estar disponível mediante solicitação. Os candidatos aprovados serão convidados a apresentar um pôster sobre sua pesquisa.
Este workshop foi possível graças ao financiamento da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), Medical Research Council (MRC), MRC Center for Global Infectious Disease Analysis, Instituto Todos pela Saúde (ITPS) e Fundação Bill e Melinda Gates.
